El Atlético Club d’Escaldes fue fundado el 20 de mayo de 2002, comenzando su andadura en segunda división. Solo una temporada más tarde, la 2003/2004, lograría el ascenso a la primera división.

Tres años más tarde, descendería de nuevo a la segunda división, permaneciendo en el ostracismo hasta la temporada 2018/2019, en la que consigue de nuevo el ascenso a Primera División de Andorra quedando campeón.

La temporada 2020/2021 comienza con una nueva propiedad y nuevos gestores al frente y se empieza a reestructurar la entidad, recuperando el fútbol base y potenciando el equipo senior. Por primera vez en su historia, el club consigue clasificarse para los playoffs por el título y disputar la final de la Copa.

Desde la temporada 2021/2022, el objetivo principal del club es convertirse en una referencia en la formación de jóvenes talentos y que el primer equipo tenga continuidad en la clasificación a competiciones europeas.

Por primera vez en la historia del club, el AC Escaldes consigue alzar la Copa Constituciò 2021/2022 y clasificarse por consiguiente para la UEFA Conference League, siendo eliminados en la primera ronda previa de dicha competición frente al Gzira United.